После переезда с одного сервера на другой была проблема с квотой на жесткий диск. Все работали, кроме этой. Не было видно даже используемого пространства.
Конечно, нужные пакеты давно стояли. Сервер был только для личного использования и это было не критично, но портило ощущение того, что всё настроено идеально.

При установке современного ISPConfig обычно он сам настраивает /etc/fstab. Но только в том случае, если диск не поделён на части, аля /var как отдельный локальный диск.

Первым делом, конечно, я попробовал изменить /etc/fstab самостоятельно по гуглоинструкциям добавляя к параметрам монтирования /var что-то в духе:

,uquota,gquota

После перемонтировав раздел

# mount -o remount /var

На этом этапе нельзя перезагружать систему. Если раздел не примонтируется, ssh не заведётся и без физического доступа что-то сделать не получится. Учтите это.
Скорее всего, он не примонтируется. Насколько я понял, этот вариант несколько устаревший. Для успешной настройки квоты, необходимо привести эту строчку в такой вид:

UUID=12345678-1234-1234-1234-1234567890 /var ext4 defaults,usrjquota=aquota.user,grpjquota=aquota.group,jqfmt=vfsv0 0 2

Соответственно, UUID у вас будет совершенно другой.
После перемонтировать раздел:

# mount -o remount /var

В случае успеха активировать их

# quotacheck -avugm
# quotaon -avug

И после перегружаться

# reboot

В самой панели всё станет видно и будет работать только минут через 10-15 из-за особенностей испконфига.

Если есть какие-то вопросы или проблемы - оставляйте комментарии, попробуем решить вместе )